神の塔1〜3階

ゼルダはネズミが苦手であること、敵のファントムの注意をそらすことができること、トラップのダメージを受けないこと、段差の上からリンクが乗れることを覚えておこう。
いきなりは何もできないので、とりあえず入口から逃げる。
シャリン様と会話後再び塔へ。
神の神殿は、模様の変わる床にいればファントムに見つからない（前作同様）
3つの光の滴を回収。（見つからない床から床へ移動しながら。）
- フロア左の滴回収。
- フロア上の滴回収。
- フロア右上のスイッチを押すとフロア右の橋がかかる（時限式）ので急いで右の滴回収。
剣が光ったらファントムを背中から攻撃。ファントムが操作可能になる。
- 左上のスイッチはブーメラン入手後に押せる。宝箱出現
2Fへ

とげの上をゼルダで移動。スイッチを押す。
2つの床スイッチを2人で押す。
先にリンクがブロックを使ってネズミ穴を塞ぎ、ネズミを退治しておいてからゼルダを誘導。
ゼルダがトゲの先へ進み、階段前のスイッチ起動後目の前のファントムの注意をそらす。
その隙にリンクがファントムを倒すか後ろを通り抜ける。音を出すと？マークをだしてファントムが持ち場を離れるので、その隙にいっても良い
3Fへ
- ひび割れをバクダンで壊した先に宝箱
- 北の宝箱は疾風のプロペラ入手後にゼルダファントムを飛ばし、ついでにスイッチも踏む
- その後リンクも向かわせ、高台から背中に乗って中央の宝箱を取る

以降森の神殿へ

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