No.曲名流れるチャプター備考
1ポケモンたんけんたいのテーマ
2トップメニュー
3ようこそ!　ポケモンたちのせかいへ!
4ゆうぐれのかいがんで
5かいがんのどうくつ
6おくそこに　ひそむもの
7タイトルキャッチ
8プクリンのギルドプクリンのギルド
9おやかたプクリン
10おやすみなさい
11プクリンのギルド　ライトアレンジ
12しめったいわば
13いらいクリア!
14トレジャータウン
15ほのぼの
16わきあがるふあん
17たいへんだ!
18トゲトゲやま
19ボスバトル!
20ときのはぐるま　ライトアレンジ
21みはりばん
22おたずねものだ!
23また　なにかみえた……
24たきつぼのどうくつ
25カクレオンのおみせポケセンダンジョンの最深部のBGMだった
26ドクローズ
27パッチールのカフェ
28ルンパッパダンス
29リンゴのもり
30えんがんのいわば
31よこあなと　よこみち主に体験版のダンジョンのBGMは全てこれ
32ツノやま
33のうむのもり
34ねっすいのどうくつ
35ねっすいのどうくつ　さいじょうぶ
36エレキへいげん
37エレキへいげん　おくち
38モンスターハウスだ!
39せまるきょうふ
40きたのさばく
41りゅうさのどうくつ
42りゅうさのどうくつ　さいしんぶ
43すいしょうのどうくつ
44だいすいしょうのみち
45いちにちの おわりに
46みらいせかいで
47ほしのていし
48くうかんのどうくつ
49くらやみのおか
50ふういんのいわば
51ふういんのいわば　さいおうぶ
52くろのもり
53もりのたかだい
54あんこくのちから
55キザキのもり
56いそのどうくつ
57いそのどうくつ　さいしんぶ
58まぼろしのだいち
59まぼろしのだいち　おくち
60ヨノワールとのたたかい
61ときのはぐるま
62ときのうみを こえてChapter-19 時の海
Chapter-19 ジュプトルとの別れ
エンディング後 そらのさけめクリア後
63みらいへ たくされたもの
64じげんのとう
65じげんのとう　さいじょうぶ
66じげんのとう　ちょうじょう
67やみにそまるもの
68けっせん! ディアルガ!Chapter-Final 対やみのディアルガ
エンディング後 対ディアルガ
SpecialEpisode-5 対やみのディアルガ
69うごきだしたじかんChapter-9 きりのみずうみ
エンディング（2回）
70ずっと　わすれない……エンディング
71いきて　かえらなきゃエンディング
72はなれていく……エンディング
73へいわへのねがいエンディング
74よみがえるきおくエンディング
75エンディング イントロエンディング
76エンディングエンディング
77エピローグエンディング
78しんぴのもり
79きょうも がんばろう!サメハダいわ(卒業後)
80シェイミのさとシェイミのさと 入口
81そらのいただき(もり)
82そらのいただき(どうくつ)救助隊の「ちていいせき」と同じ
83そらのいただき(そうげん)
84そらのいただき(いわば)救助隊の「あらしのかいいき」のアレンジ
85そらのいただき(ゆきやま)
86そらのいただき(さいごのみちのり)
87ふぶきのしま(きゅうじょたいメドレー)ひょうせつのれいほう
てんくうのとう
ライメイのやま
でんじはのどうくつ の順番
88とざされたうみ
89きせきのうみ
90ばんにんのどうくつ
91でんせつへのちょうせん
92かくされたいせき「ばんにんのどうくつ」のアレンジ
93しゅぎょうのやま
94あくむのなか
95パルキアしゅうらい!
96やみのかこう
97やみのかこう　さいしんぶ
98ランダムダンジョン1
99ランダムダンジョン2
100ランダムダンジョン3
101ガラガラどうじょう
102ペリッパーのしま「トップメニュー」のおとなしいver
103おもいやるきもちSpecialEpisode-1 プロローグ／エンディング
104ゆめのむこうSpecialEpisode-1
105あやしいくうきSpecialEpisode-1
106ほしのどうくつSpecialEpisode-1
107ほしのどうくつ　おくちSpecialEpisode-1
108せいぎのみかたSpecialEpisode-1「プクリンのギルド」のアレンジ
109アンコクのもりSpecialEpisode-2救助隊「ちいさなもり」と同じ曲
110たのしいたんけんSpecialEpisode-2
111ざいほうのいわばSpecialEpisode-2
112ざいほうのいわば　おくちSpecialEpisode-2
113ウソだ……SpecialEpisode-2
114まもりのオーブSpecialEpisode-2
115まもりのオーブ(エンディング)SpecialEpisode-2 エンディング
116げんせんのどうくつSpecialEpisode-3救助隊「マグマのちてい」と同じ曲
117げんせんのどうくつ　かそうぶSpecialEpisode-3救助隊「マグマのちてい　さいかそう」と同じ曲
118げんせんのどうくつ　さいしんぶSpecialEpisode-3救助隊「マグマのちてい　さいかそう」のアレンジ
119チャームズさんじょう!SpecialEpisode-4 タイトル「チャームズのテーマ」のオープニングのみ
120みなみのジャングルSpecialEpisode-4救助隊のともだちエリア（ジャングル）と同じ曲
121きょだいがんせきぐんSpecialEpisode-4救助隊「ハガネやま」のアレンジ
122げんえいのいわべやSpecialEpisode-4
123だいしょうにゅうどうSpecialEpisode-4
124だいしょうにゅうどう　おくちSpecialEpisode-4
125チャームズのテーマSpecialEpisode-4 ボス戦
126あらたな　いのちのためにSpecialEpisode-5
127こかつのたにSpecialEpisode-5
128くらがりのこうやSpecialEpisode-5
129くうかんのがんぺきSpecialEpisode-5
130くらやみのひょうざんSpecialEpisode-5
131いきるたましいSpecialEpisode-5
132ひょうちゅうのもりSpecialEpisode-5
133きざまれたほこりSpecialEpisode-5
134だいひょうざんSpecialEpisode-5「じげんのとう」のアレンジ
135だいひょうざん　さいじょうぶSpecialEpisode-5「じげんのとう」のアレンジ
136あさひのなかでSpecialEpisode-5
137あたらしいせかいSpecialEpisode-5
138きせきではないSpecialEpisode-5
139なかまへのおもいSpecialEpisode-5
140かぜよ!　もしとどくならSpecialEpisode-5
141オレたちはいきている!(エンディング)SpecialEpisode-5 エンディング