ランダム出現のボス

ポケモン出現場所
ミュウツー全フィールドのファクトリーエリア（バトルロイヤルEX-6クリア済）
ルギア全フィールドのピーチエリア
ホウオウ3-2 かざんのふもとのレッドエリア
3-3 ひをふくやまのレッドエリア
ラティアス全フィールドのグリーンエリア
ラティオス全フィールドのグリーンエリア
カイオーガ全フィールドのビーチエリア
グラードン全フィールドのマグマエリア
レックウザ全フィールドのタワーエリア
デオキシス全フィールドのファクトリーエリア
ディアルガ全フィールドのケイプエリア
パルキア全フィールドのレイクエリア
ヒードラン全フィールドのマグマエリア
レジギガス全フィールドのデザートエリア
ギラティナ
（アナザーフォルム）		全フィールドのホラーエリア
ギラティナ
（オリジンフォルム)
クレセリア全フィールドのツリーエリア
ダークライ全フィールドのホラーエリア
アルセウス全フィールドのタワーエリア（チームバトルEX-6クリア済）
コバルオンビリジオンかテラキオンを仲間にしたのち、もう片方を倒すと出現する。
テラキオン全フィールドのロックエリア
ビリジオン全フィールドのフォレストエリア
トルネロス3-2 かざんのふもとのレッドエリア（3回以上戦っていると出現）
ボルトロス3-3 ひをふくやまのレッドエリア（3回以上戦っていると出現）
レシラム全フィールドのケイブエリア
ゼクロム
ランドロス3-2 かざんのふもとのレッドエリア（トルネロスとボルトロスの両方にボスとして出会っていると出現）
キュレム全フィールドのアイスエリア