時の探検隊と闇の探検隊では出現するポケモンとどうぐに若干の違いがある。

野生ポケモン

ダンジョン内で出現するポケモンの違い。

相手のバージョンのポケモンは基本的に野生では出現しない。

不思議なメールで一度でも依頼主やお尋ね者として呼べば、その後普通に出現するようになる。

もちろん、下位から進化させたりたまごから孵化させれば仲間に出来る。

なお、ミノムッチに関しては、一度条件を満たせばミノ違い3種全てが出現するようになる。

時の探検隊のみ
パチリス　ミツハニー　バタフリー　リオル　など
闇の探検隊のみ
ミミロル　ミノムッチ　スピアー　ロトム　など

伝説のポケモン

時はセレビィ、闇はミュウツーが仲間に出来ます。

時にミュウツー・闇にセレビィを出現させるには、2008/02/14（木）までにWi-Fiで配信の不思議なメールを受ける必要があります。
詳しくは伝説のポケモン　まとめを参照。
伝説のポケモンにはひみつのせきばんとなぞのパーツが必要なポケモンもいます。

登場どうぐ

ダンジョン内で拾える道具、およびショップで売られる道具の違い。

相