No.曲名流れるチャプターorダンジョン備考
1ポケモンたんけんたいのテーマ
2トップメニュー
3ようこそ! ポケモンたちのせかいへ!
4ゆうぐれのかいがんで
5かいがんのどうくつ
6おくそこに ひそむもの
7タイトルキャッチ
8プクリンのギルド
9おやかたプクリン
10おやすみなさい
11プクリンのギルド ライトアレンジ
12しめったいわば
13いらいクリア!
14トレジャータウン
15ほのぼの
16わきあがるふあん
17たいへんだ!
18トゲトゲやま
19ボスバトル!
20ときのはぐるま ライトアレンジ
21みはりばん
22おたずねものだ!
23また なにかみえた……
24たきつぼのどうくつ
25カクレオンのおみせ
26ドクローズ
27パッチールのカフェ
28ルンパッパダンス
29リンゴのもり
30えんがんのいわば
31よこあなと よこみち
32ツノやま
33のうむのもり
34ねっすいのどうくつ
35ねっすいのどうくつ さいじょうぶ
36エレキへいげん
37エレキへいげん おくち
38モンスターハウスだ!
39せまるきょうふ
40きたのさばく
41りゅうさのどうくつ
42りゅうさのどうくつ さいしんぶ
43すいしょうのどうくつ
44だいすいしょうのみち
45いちにちの おわりに
46みらいせかいで
47ほしのていし
48くうかんのどうくつ
49くらやみのおか
50ふういんのいわば
51ふういんのいわば さいおうぶ
52くろのもり
53もりのたかだい
54あんこくのちから
55キザキのもり
56いそのどうくつ
57いそのどうくつ さいしんぶ
58まぼろしのだいち
59まぼろしのだいち おくち
60ヨノワールとのたたかい
61ときのはぐるま
62ときのうみを こえてChapter-19 時の海
Chapter-19 ジュプトルとの別れ
エンディング後 そらのさけめクリア後
63みらいへ たくされたもの
64じげんのとう
65じげんのとう さいじょうぶ
66じげんのとう ちょうじょう
67やみにそまるもの
68けっせん! ディアルガ!Chapter-Final 対やみのディアルガ
エンディング後 対ディアルガ
SpecialEpisode-5 対やみのディアルガ
69うごきだしたじかんChapter-9 きりのみずうみ
エンディング(2回)
70ずっと わすれない……エンディング
71いきて かえらなきゃエンディング
72はなれていく……エンディング
73へいわへのねがいエンディング
74よみがえるきおくエンディング
75エンディング イントロエンディング
76エンディングエンディング
77エピローグエンディング
78しんぴのもり
79きょうも がんばろう!
80シェイミのさと
81そらのいただき(もり)
82そらのいただき(どうくつ)救助隊の「ちていいせき」と同じ
83そらのいただき(そうげん)
84そらのいただき(いわば)救助隊の「あらしのかいいき」のアレンジ
85そらのいただき(ゆきやま)
86そらのいただき(さいごのみちのり)
87ふぶきのしま(きゅうじょたいメドレー)ひょうせつのれいほう
てんくうのとう
らいめいのやま
でんじはのどうくつ の順番
88とざされたうみ
89きせきのうみ
90ばんにんのどうくつ
91でんせつへのちょうせん
92かくされたいせき
93しゅぎょうのやま
94あくむのなか
95パルキアしゅうらい!
96やみのかこう
97やみのかこう さいしんぶ
98ランダムダンジョン1
99ランダムダンジョン2
100ランダムダンジョン3
101ガラガラどうじょう
102ペリッパーのしま
103おもいやるきもち
104ゆめのむこう
105あやしいくうき
106ほしのどうくつ
107ほしのどうくつ おくち
108せいぎのみかた
109アンコクのもり救助隊の「ちいさなもり」と同じ
110たのしいたんけん
111ざいほうのいわば
112ざいほうのいわば おくち
113ウソだ……
114まもりのオーブ
115まもりのオーブ(エンディング)
116げんせんのどうくつ
117げんせんのどうくつ かそうぶ
118げんせんのどうくつ さいしんぶ
119チャームズさんじょう!
120みなみのジャングル
121きょだいがんせきぐん
122げんえいのいわべや
123だいしょうにゅうどう
124だいしょうにゅうどう おくち
125チャームズのテーマ
126あらたな いのちのために
127こかつのたに
128くらがりのこうや
129くうかんのがんぺき
130くらやみのひょうざん
131いきるたましい
132ひょうちゅうのもり
133きざまれたほこり
134だいひょうざん
135だいひょうざん さいじょうぶ
136あさひのなかで
137あたらしいせかい
138きせきではない
139なかまへのおもい
140かぜよ! もしとどくなら
141オレたちはいきている!(エンディング)